Komançilerin kökeni, Uto-Aztek diline dayanan ve 16. yüzyılın başlarında kuzey Büyük Ovalardan Orta Amerika'ya kadar uzanan bir geçmişe sahiptir. Bazı köken teorileri: Sibirya göçü: Genetik araştırmalar, Komançilerin Asya kökenli olduğunu ve Sibirya bölgesinden göç ederek Kuzey Amerika'ya geldiklerini desteklemektedir. Türk dili benzerliği: Komançi dilinin bazı ortak özellikler taşıdığı ve Türk dilleriyle benzerlikler gösterdiği belirtilmektedir. Komançilerin en eski tarihi kaydı, 1706 yılına aittir ve bugün New Mexico olan Taos'taki İspanyol karakolundan bir rahibin Santa Fe valisine yazdığı bir mektupta yer almaktadır.