Ege ile Gaga'nın konusu, Ege adlı küçük bir çocuk ile onun Gaga adını verdiği bir karganın her bölümde merak ettikleri bir şeyi araştırmalarını ve çeşitli maceralara atılmalarını anlatır 15.

Ege, taşrada, harika bir doğa ortamında yaşamaktadır 5. Birlikte bazen komşu çiftlikte atları gözlemleyerek onların hayatlarını incelerler, bazen bahçedeki kuyuda biten suyun nedenini araştırırlar 5. Bazı bölümlerde büyüteç kullanarak dedektiflik yaparlar ya da çeşitli oyunlar kurgularlar 5.

Her bölümde küçük bazı bilgiler verilen çizgi dizide, öğrenme merakı, yardımlaşma, sorun çözme ve arkadaşlık gibi temalar işlenir 5. Ayrıca, birçok bölümde farklı hayvan türleri, bazı bilimsel gerçekler ve doğanın işleyişi anlaşılır ve basit bir dille anlatılır 5.