Bozdoğan Su Kemeri'nin hikayesi şu şekilde özetlenebilir: İnşası: Kemerin inşasına ilk ne zaman başlandığı kesin olmamakla birlikte, İmparator Konstantin’in hüküm sürdüğü 306-337 yılları arasında bir tarih olduğu kabul edilmektedir. Kullanım Amacı: Bayezid ile Fatih semtleri arasındaki çukurun ortadan kaldırılarak şimdiki üniversitenin bahçesindeki büyük havuza su depolamak amacıyla inşa edilmiştir. Tarihsel Kullanım: 6. yüzyılda Bizans şehri saraylarına, Ahilleus Hamamı’na ve Yerebatan Sarnıcı’na su sağlamak ve civardaki bağ ve bahçelerin sulanması için kullanılmıştır. Tamir ve Eklemeler: Bizans devrinde Justinianus, İkinci Justinus, Konstantino ve İkinci Basileus tarafından tamir ettirilmiştir. Günümüzdeki Durumu: 1988 senesinde tamirine başlanmış ve 1990’da bitirilmiştir.