Azeri Türklerinin kökeni çeşitli etnik ve dilsel kökenlere dayanmaktadır. İran kökenleri: Azeri halkının İran coğrafyasına özgü kökleri olduğu, İran dili olan Eski Azericenin varlığı ve İran halkları ile kültürel benzerlikler gibi kanıtlarla desteklenmektedir. Orta Asya kökenleri: 11. yüzyılda Oğuz Türkleri ve Türkmen boylarının akınlarıyla Türkleşme süreci hızlanmıştır. Kafkas kökenleri: Azerbaycan'ın tarih boyunca Kafkasya halkları ile etkileşimi, etnik yapıda Kafkas unsurlarının da yer almasına neden olmuştur. Genetik testler, Azeri Türklerinin çoğunluğu için otokton bir arka planı destekleyen ortak genetik belirteçleri ortaya çıkarmıştır.