Apollon Tapınağı'nın hikayesi şu şekilde özetlenebilir: - Antik Dönem: Didim'deki Apollon Tapınağı, Yunanların kehanet gücü verdiğine inandıkları bir doğal kaynağın çevresine inşa edilmiştir. - Pers İstilası: Tapınak, MÖ 494 veya 479 yılında Pers Kralı Darius ya da oğlu Xerxes tarafından yağmalanmış ve talan edilmiştir. - İskender'in Onarımı: Efsaneye göre, kutsal sayılan kaynak, Büyük İskender'in MÖ 331'de Doğu Seferi'ne çıkıp tapınağa kutsiyetini geri verene dek kurumuştur. - Yeniden İnşa: Tapınak, MÖ 4. yüzyılda yeniden inşa edilmeye başlanmış ve Helenistik dönemde büyük bir yapı haline getirilmiştir. - Geç Antik Çağ: MS 5. veya 6. yüzyılda, tapınak Hristiyanlarca kiliseye dönüştürülmüştür. Ayrıca, tapınağın hikayesinde, tanrı Apollon'un çoban Brankhos'a kehanet yeteneğini öğretmesi ve tapınağın bu şekilde yapılması gibi mitolojik unsurlar da yer almaktadır.