Sayıştay, aşağıdaki kurumları denetler: 1. Merkezi yönetim bütçesi kapsamındaki kamu idareleri ve sosyal güvenlik kurumları. 2. Mahallî idareler. 3. Sermayesinde doğrudan veya dolaylı olarak kamu payı olan özel kanunlar veya Cumhurbaşkanlığı kararnameleri ile kurulmuş anonim ortaklıklar. 4. Diğer kamu idareleri (kamu kurumu niteliğindeki meslek kuruluşları hariç). 5. Kamu idareleri tarafından yapılan iç ve dış borçlanma, borç verilmesi, borç geri ödemeleri gibi işlemler. 6. Avrupa Birliği fonları dahil yurt içi ve yurt dışından sağlanan diğer kaynaklar ve fonlar. Ayrıca, Sayıştay, uluslararası kuruluş ve örgütlerin hesap ve işlemlerini de denetleyebilir.