Mutabakata itiraz edilmesi durumunda taraflar arasındaki anlaşmazlık çözülür ve mutabık kalınamayan bilgiler karşılıklı olarak paylaşılır. İtiraz, noter aracılığıyla, taahhütlü mektupla, güvenli elektronik imza içeren bir yazıyla ya da e-mutabakat yöntemleriyle yapılabilir. Mutabakat zorunluluğuna uyulmaması, sözleşme ihlali, ceza ve hukuki yaptırımlarla sonuçlanabilir.