Genelkurmay Başkanlığı'nda bulunan belgeler arasında şunlar yer almaktadır: 1. Dersim Olaylarına İlişkin Belgeler: 2013 yılında Genelkurmay Başkanlığı'ndan TBMM Dilekçe Komisyonu'na yaklaşık 46 bin sayfa belge gönderilmiştir. 2. Kozmik Oda Belgeleri: 2010 yılında Bülent Arınç'a suikast iddiasıyla girilen Kozmik Oda'dan derlenen bilgi ve belgeler, daha sonra "devlet sırrı niteliğinde olmadıkları" gerekçesiyle Savcılığa teslim edilmiştir. 3. Girit ve Sisam Adalarındaki Terör Eylemlerine İlişkin Belgeler: Genelkurmay Askeri Tarih ve Stratejik Etüt Başkanlığı (ATASE), Girit ve Sisam adalarında yaşanan ayrılıkçı terör eylemlerine ait belgeleri gün ışığına çıkarmıştır. 4. 1915 Olaylarına İlişkin Belgeler: Genelkurmay ATASE Daire Başkanlığı arşivinde, 1915 olaylarına dair belgeler de bulunmaktadır.