Ahmet Davutoğlu'nun istifasının başlıca nedenleri arasında Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan ile yaşadığı gerginlikler yer almaktadır. Bu gerginlikler, özellikle şu konularda ortaya çıkmıştır: Şeffaflık yasası: Davutoğlu'nun yolsuzlukların önlenmesi için çıkarmak istediği şeffaflık yasasına Erdoğan'ın karşı çıkması. Başkanlık sistemi: Davutoğlu'nun başkanlık sistemine mesafeli olması. Koalisyon hükûmeti: 7 Haziran 2015 seçiminden sonra Davutoğlu'nun koalisyon hükûmeti kurma isteği, Erdoğan'ın ise erken seçim talebi. Medya ve basın: Davutoğlu'nun bazı medya unsurlarını sansürlemekle suçlanması. Ayrıca, 29 Nisan 2016'da AK Parti MKYK'sının Davutoğlu'nun yetkilerini kısıtlaması ve Mayıs 2016'da Pelikan Dosyası adı verilen bir bildirinin yayılması da istifaya giden süreçte önemli olaylar olarak kabul edilmektedir.