Zeytin ağacını en çok öldüren faktörler arasında hastalıklar ve zararlılar bulunmaktadır. Hastalıklar: Armillaria kök çürüklüğü: Zeytin ağaçlarının köklerinde çürüklük yaparak ağaçların ölümüne neden olur. Rosellinia kök çürüklüğü: Özellikle taban ve sulanan arazilerde büyük zarar verir. Zararlılar: Zeytin sineği (Bactrocera oleae): Meyve etinde zarar oluşturarak meyvelerin çürümesine ve dökülmesine, dolayısıyla verim ve kalite kaybına yol açar. Zeytin kabuklu biti (Parlatoria oleae): Bitki özsuyunu emerek ağaçları zayıflatır ve verim kaybına neden olur. Zeytin karakoşnili: Özsuyu emerek ağaçları zayıflatır ve yaprak ile meyve dökümlerine yol açar. Bu zararlı ve hastalıklarla mücadele için kültürel ve kimyasal yöntemler uygulanabilir.