Tarpan atının yok olmasının birkaç nedeni vardır: 1. Habitat kaybı: Tarpan, orman ve bozkır bölgelerinde yaşıyordu, ancak şehirlerin, köylerin ve tarım alanlarının genişlemesi doğal yaşam alanlarını yok etti. 2. Avlanma: Tarpan eti bir incelik olarak kabul edildi ve bu nedenle yoğun bir şekilde avlandı. 3. Melezleşme: Tarpan, evcil atlarla melezleşti ve bu durum genetik saflığını bozdu. 4. Çiftçilerle çatışma: Tarpanların ekinleri tahrip etmesi ve evcil kısrakları kaçırması, çiftçilerle aralarının açılmasına neden oldu.