Mini akvaryumların kaç günde bir temizlenmesi gerektiği, akvaryumun büyüklüğüne, içindeki canlı sayısına ve filtre sistemine bağlı olarak değişebilir. Temizlik sırasında yapılması gerekenler: Su değişimi: Suyun %70'i yenilenir, %30'u eski su ile tamamlanır. Filtre temizliği: Filtre süngeri, akvaryum suyuyla yıkanarak temizlenir. Dekor ve taşların temizlenmesi: Kimyasal kullanmadan yıkanırlar. Dip temizliği: Akvaryum dibindeki süsler ve taşlar temizlenerek kirler giderilir.