Santorini depremlerinin yanardağ kaynaklı olup olmadığı kesin olarak belirlenememiştir. Depremler, hem fay hareketliliğinin hem de volkanizmanın iç içe geçtiği bir bölgede meydana gelmektedir. Ancak, Kolumbo yanardağının deprem fırtınasının odak noktası olduğu ve bu yanardağın geçmişte büyük patlamalar yaptığı bilinmektedir.