Kanatlı hayvanlarda en çok görülen hastalıklar arasında solunum yolu hastalıkları ve koksidiyoz öne çıkmaktadır. Solunum yolu hastalıkları, tavuklarda sıklıkla görülür ve genellikle solunumda zorlanma, hırıltılı solunum, öksürük, hapşırık, ağız ve burun akıntısı, depresyon hali ile kendini gösterir. Koksidiyoz, kanatlı hayvanlarda ishal, kanlı ishal, kilo kaybı ve performans düşüklüğüne neden olan bir protozoal hastalıktır. Ayrıca, Newcastle hastalığı, tavuk kolerası ve salmonellozis gibi hastalıklar da kanatlı hayvanlarda sıkça karşılaşılan hastalıklar arasındadır.