Eozinofilik granülomanın kesin nedeni bilinmemekle birlikte, birkaç faktörün rol oynadığı düşünülmektedir: 1. Genetik yatkınlık: MAPK/ERK sinyal yolağında genetik mutasyonlar hastalığın gelişiminde etkili olabilir. 2. Çevresel faktörler: Kimyasallar ve çevresel toksinlere maruz kalma granülom oluşumunu tetikleyebilir. 3. Bağışıklık sistemi düzensizliği: Abnormal bağışıklık tepkileri, eozinofil ve diğer bağışıklık hücrelerinin aşırı üretimine yol açarak granülomlara neden olabilir. Ayrıca, pire, sivrisinek veya akar ısırıkları gibi alerjik reaksiyonlar da kedilerde eozinofilik granülom kompleksinin ortaya çıkmasına katkıda bulunabilir.