Ege Denizi'nde bulunan bazı balık türleri şunlardır: Demersal balıklar: Barbun, çipura, dil balığı, fener, hamsi, istavrit, kefal, levrek, orfoz, sinarit, tekir, tirsi ve uskumru. Pelajik balıklar: Akya, kılıç, kolyoz, kupez, lahoz, lüfer ve palamut. Nekton balıkları: Mürekkep balığı, yılan balığı ve köpek balığı. Ege Denizi'nde bulunan diğer balık türlerinden bazıları ise şunlardır: eşkina; horozbina balığı; iskaroz (papağan balığı); iskorpit balığı; izmarit balığı; kırma mercan; mandagöz mercan balığı; melanur balığı; mersin balığı; trakonya balığı.