Batık minare, suyun altında kalmasının nedeni, 1991 yılında Kızılırmak üzerine Devlet Su İşleri tarafından Derbent Barajı'nın kurulmasıdır. Bu barajın inşası sırasında, Samsun'un Bafra ilçesinde bulunan Boğazkaya köyündeki yapıların büyük bir kısmı sular altında kalmış, sadece caminin minaresi yıkılmadan su üstünde kalmıştır.