Balık kafesi genellikle 1-5 metre derinliğe atılır 5.

Ancak, balıkların yoğun olarak bulunduğu derinlikler araştırılarak kafes bu derinliklere de yerleştirilebilir 5. Örneğin, çipura ve levrek yetiştiriciliği yapılan ağ kafeslerde ağların en dip noktası 30 metre derinliğe kadar ulaşabilir 3.

Kafesin yerleştirileceği derinliğin, suyun akışı ve bitki örtüsü gibi diğer faktörlere bağlı olarak belirlenmesi önerilir 5.