Ayvalık'ta deniz suyu en soğuk Mayıs ayının sonları ve Haziran başları gibi erken yaz dönemlerinde, genellikle 19-20 derece civarında olur. Yaz aylarında ise Temmuz ve Ağustos aylarında deniz suyu sıcaklığı genellikle 24-27 derece arasında seyreder. Eylül ayının ilk yarısı da hala yazın sıcaklığını koruduğu için deniz suyu 23-25 derece civarında olabilir. Deniz suyu sıcaklığı, hava sıcaklığıyla doğrudan ilişkili olduğundan, gitmeden önceki günlerin ve gidilecek günün hava durumu tahminlerinin kontrol edilmesi önerilir.