Akvaryum motoru, genellikle hava motoru olarak bilinir ve şu şekilde çalışır: Basınç sağlama: Motor, akvaryuma basınç uygulayarak suda dalgalanmalar oluşturur. Oksijenlendirme: Oluşan dalgalanmalar sayesinde doğal bir sirkülasyon meydana gelir ve oksijen oluşur. Filtrasyon desteği: Bazı filtre sistemleri, özellikle sünger filtreler, hava motoruyla çalışır. Dekoratif etki: Hava kabarcıkları, akvaryuma estetik bir görünüm kazandırır. Akvaryum motorunun sürekli çalıştırılması önerilir, çünkü içerideki canlılar oksijenle bu sayede buluşur.