"Yozakura-san Chi no Daisakusen", Taiyo Asano'nun, çocukluk arkadaşı Mutsumi Yozakura'nın bir casus ailesinin üyesi olduğunu öğrenmesini ve Mutsumi'yi korumak için onun koruyucusu olmayı kabul etmesini konu alır. Mutsumi'nin ağabeyi Kyoichiro, Mutsumi'yi aşırı koruduğu için Taiyo'yu bir tehdit olarak görür ve onu öldürmeye çalışır. Taiyo, Mutsumi'yi korumak ve Yozakura ailesinin bir üyesi olmak için casusluk eğitimi alır.