What If...? 3. sezonunda gerçekleşecek bazı olaylar şunlardır: 1. "The Hulk Fought the Mech Avengers?" bölümünde, Bruce Banner'ın Hulk'a dönüşme çabası ters gider ve Anthony Mackie'nin Kaptan Amerika'sı, devasa bir mech suit ile Hulk'a karşı savaşır. 2. "Agatha Went to Hollywood?" bölümünde, Kathryn Hahn'ın Agatha Harkness'ı, Dominic Cooper'ın Howard Stark'ın film stüdyosunda başrol oyuncusu olur. 3. "The Red Guardian Stopped the Winter Soldier?" bölümünde, David Harbour'ın Red Guardian'ı, 1991 yılında Winter Soldier'ın Howard Stark'ı öldürme görevine müdahale eder. 4. "Howard the Duck Got Hitched?" bölümünde, Darcy Lewis ve Howard the Duck, galaksiler arası bir zevk gezisine çıkar ve bu gezi tehlikeli güçlerle tehdit edilir. 5. "The Emergence Destroyed the Earth?" bölümünde, Spider-Man: Far From Home'dan Mysterio'nun yer aldığı bir evrende, Eternals'ın asla Emergence'ı durdurmadığı bir dünyada geçen olaylar anlatılır. 6. "1872?" bölümünde, Simu Liu'nun Shang-Chi ve Hailee Steinfeld'in Kate Bishop'ı, 1872 yılında yeni bir MCU kötü adamı olan The Hood'a karşı mücadele eder. 7. "The Watcher Disappeared?" bölümünde, The Watcher, yaptığı müdahaleler nedeniyle yargılanır. 8. "What If... What If?" finalinde, dizinin "başlangıcı sonu" olarak tanımlanır ve MCU'nun Avengers ve X-Men evrenleri arasında bir crossover yaşanır.