What If... 3. sezonunda çeşitli alternatif evrenlerde gerçekleşen olaylar ele alınmıştır. İşte bazı bölümler ve konuları: 1. "What If... The Hulk Fought the Mech Avengers?": Mark Ruffalo'nun canlandırdığı Bruce Banner'ın yanlışlıkla güçlenmesi ve Anthony Mackie'nin Kaptan Amerika'sının mech kıyafetiyle onu durdurma çabası. 2. "What If... Agatha Went to Hollywood?": Kathryn Hahn'ın Agatha Harkness'ı, Dominic Cooper'ın Howard Stark ile birlikte film stüdyosu kurar ve süper güçlü bir yardımcı oyuncu olan Kumail Nanjiani'nin Kingo'su ile tanışır. 3. "What If... The Red Guardian Stopped the Winter Soldier?": David Harbour'ın Red Guardian'ı, 1991 yılında Winter Soldier'ın Howard Stark'ı öldürme görevine müdahale eder. 4. "What If... Howard the Duck Got Hitched?": Darcy Lewis ve Howard the Duck, galaksiler arası bir zevk gezisine çıkar ve güçlü kozmik güçlerle karşılaşırlar. 5. "What If... The Emergence Destroyed the Earth?": Dominique Thorne'un Riri Williams'ı, Quentin Beck'in otoriter rejimine karşı bir grup özgürlük savaşçısına liderlik eder. 6. "What If... 1872?": Simu Liu'nun Shang-Chi ve Hailee Steinfeld'in Kate Bishop'ı, 1872 yılında yeni bir MCU kötü adamı olan The Hood'a karşı mücadele eder. 7. "What If... The Watcher Disappeared?": Jeffrey Wright'ın Watcher'ı, tüm sezonlardaki müdahaleleri nedeniyle yargılanır.