"Wayward Pines" dizisinin konusu, Blake Crouch'un romanına dayanarak, bir Gizli Servis ajanının Idaho'daki gizemli bir kasaba olan Wayward Pines'ta iki kayıp federal ajanı bulma görevini üstlenmesiyle gelişir 14.

Ajan, kasabaya geldikten sonra dış dünyayla iletişim kuramadığını ve buradan çıkamayacağını fark eder 3. Kasabanın sakinleri, elektrikli bir çit ve Şerif Arnold Pope'un uyguladığı katı kurallarla oraya hapsolmuştur 4. Herhangi bir kaçış girişimi, "hesaplaşma" olarak bilinen ve Şerif'in mahkûmun boğazını kesmesiyle sonuçlanan bir kamu infazıyla cezalandırılır 4.

Ajan, karısıyla oğlunu yeniden bir araya getirirken, aynı zamanda Wayward Pines'ın gerçeğini de ortaya çıkarmaya çalışır 4.