Animatrix, Matrix evreninin bir parçasıdır ancak aynı değildir. Animatrix, Matrix evreninde geçen, 2003 yapımı dokuz animasyon kısa filmi içeren bir antolojidir. Matrix üçlemesi ise, Wachowski kardeşlerin yönettiği, distopik bir gelecekte geçen ve makinelerin insanları köleleştirdiği bir hikayeyi anlatan film serisidir. Dolayısıyla, Animatrix ve Matrix aynı evrene ait olsa da, Animatrix daha çok arka plan hikayeleri ve bağlam açıklamaları sunan bir yan ürün olarak kabul edilir.