"Sen Ağlama İstanbul" dizisinin konusu, tıp fakültesinde okuyan güçlü ve umut dolu genç bir kadın olan Şehrazat'ın hayatını anlatır. Şehrazat, sevgilisi Ferhat ile mutlu bir gelecek hayali kurarken, Ferhat'ın işlemediği bir suç nedeniyle idam cezasına çarptırılması tüm hayatlarını altüst eder. Şehrazat, sevdiği adamı darağacından kurtarmak için karanlık nüfuzuyla tanınan Büyükbey'den yardım ister. Dizide, Büyükbey'in kızı Şirin ve yeğeni Kubat'ın evliliği ile imparatorluğunu koruma planları da işlenir.