Scarlet Nexus anime serisi, 2020 yılında ortaya çıkan ve insan beyinlerini yiyen "Diğerleri" adlı yaratıklara karşı mücadele eden bir özel görev gücünün hikayesini anlatıyor. Konu özeti: - İnsanlar arasında psionikler olarak bilinen ve extrasensör yeteneklere sahip olanlar keşfedilir. - Ulusun kurucusu, bu psionikleri eğiterek "Scarlet Muhafızları" olarak bilinen Diğerleri Bastırma Gücü'nü (OSF) oluşturur. - Yuito Sumeragi, OSF'ye katılan bu gençlerden biridir ve beş yaşındayken bir OSF askeri tarafından kurtarıldığı için onlara borçlu hisseder. - Ancak Yuito, ülkeyi tehlikeye atabilecek karanlık bir komployu keşfeder.