Rafadan Tayfa Göbeklitepe filminde, Akın'ın Şanlıurfa'daki arkadaşı Veysi'den gizemli bir paket alması ile başlayan olaylar zinciri anlatılır. Paketten çıkan bakır sini, Akın ve Rafadan Tayfa ekibi için büyük bir merak konusu olur. Tayfa, sininin Göbeklitepe ile ilgili olduğunu anlar ve onu, Göbeklitepe'nin kaşifi Başkan Amca'ya göstermeye karar verir. Bu sırada hapisten kaçan Kazım Amca da, ünlü bir milyoner adamın yardımıyla Tayfa'nın izini sürmeye başlar.