"My Deer Friend Nokotan" dizisinin konusu, Torako Koshi adlı bir kızın, Nokotan adında boynuzları olan bir değişim öğrencisiyle tanıştıktan sonra hayatının nasıl değiştiğini anlatır. Torako, dışarıdan örnek bir öğrenci olarak görünse de, aslında çeteci bir geçmişe sahiptir. Torako, bir yandan model öğrenci imajını korumaya çalışırken, bir yandan da Nokotan'a insan hayatında rehberlik eder ve birlikte Deer Club'u kurarlar.