Kraliçe Seondeok, 17 Şubat 647'de, 40 yaşındayken vefat etmiştir 145.

Bazı kaynaklara göre, hastalığının tam olarak ne olduğu veya ölümünün kesin nedeni tanımlanmamıştır 45.

Diğer bir teoriye göre ise, Kraliçe Seondeok'un Bidam'a güvenmesi ve onun ihaneti, onda şok etkisi yaratmış ve bu durum sağlığını olumsuz etkilemiştir 45.

Kraliçe, ölümünden bir gün önce saraylılarını toplayarak öleceğini ve cenazesinin Nangsan'da (Kurt Dağı) bir yere defnedileceğini duyurmuştur 2. Tam tahmin ettiği günde vefat etmiş ve Nangsan'daki bir mezara defnedilmiştir 2.