"Monster Musume", insanların fantastik varlıklarla bir arada yaşadığı bir dünyada geçen bir hikayedir. Konu, Kimihito Kurusu adlı bir Japon öğrencinin, "Interspecies Cultural Exchange" programı kapsamında evine farklı türlerden kız arkadaşların gelmesiyle hayatının nasıl değiştiğini anlatır. Kimihito, bu yeni duruma uyum sağlarken, kız arkadaşlarının sürekli romantik ilerlemeleriyle de başa çıkmak zorunda kalır.