Matrix 1, insanlığın ürettiği makinelerin (yapay zekanın) gelişmesi sonrası, insanları bir simülasyonda tutsak etmesi konusunu anlatır. Filmin hikayesi özetle şu şekildedir: - Thomas Anderson (Neo), gündüzleri saygın bir yazılım firmasında bilgisayar programcısı olarak çalışırken, geceleri hacker kimliği ile Matrix'i araştırır. - Neo, esrarengiz şekilde Trinity ve Morpheus ile tanışır ve yaşadığı dünyanın aslında bir simülasyondan ibaret olduğunu öğrenir. - Neo, Morpheus'un önderliğindeki ekibe katılarak Matrix'ten kurtulmaya çalışır ve makinelere karşı verilen savaşın en önemli parçası haline gelir. Film, istenmeyen bir distopik geleceği ve insanın gerçekliği algılama şeklini sorgulamayı işler.