Mandıra Filozofu İstanbul, modern yaşamın getirdiği karmaşalarla boğuşan insanlara, sade bir hayatın erdemini mizahi bir dille anlatıyor. Filmin konusu, Milas'ın Çökertme köyünde yaşayan Mustafa Ali'nin, yıllar önce kendisini ve annesini terk eden babasıyla helalleşmek için İstanbul'a gelmesini ve burada modern dünya ile yüzleşmesini işliyor. Ayrıca, film toplumsal eleştiriler de içeriyor. Genel olarak, filmdeki mesajlar, basit ve uygulanabilir nitelikte olsa da, bunları hayata geçirmenin zor olduğu ima ediliyor.