JoJo's Bizarre Adventure animesi, Joestar ailesinin farklı nesillerinin doğaüstü güçlere sahip düşmanlara karşı verdiği mücadeleyi konu alır. Seri, her biri farklı bir hikâyeye odaklanan altı ana sezondan oluşur: 1. Phantom Blood: 19. yüzyılın sonunda, Jonathan Joestar'ın üvey kardeşi Dio Brando'ya karşı verdiği savaşı anlatır. 2. Battle Tendency: 1930'larda, Jonathan'ın torunu Joseph Joestar'ın antik varlıklar olan Pillar Men'e karşı mücadelesini işler. 3. Stardust Crusaders: 1980'lerde, Jotaro Kujo'nun büyükbabası ve ekibiyle birlikte Mısır'a gidip Dio Brando'yu durdurma çabalarını ele alır. 4. Diamond is Unbreakable: 1999 yılında, Josuke Higashikata'nın kasabasında ortaya çıkan tehlikeli Stand kullanıcılarıyla mücadelesini anlatır. 5. Golden Wind: 2001 yılında, Dio Brando'nun oğlu Giorno Giovanna'nın mafya örgütüne sızarak yozlaşmış düzeni yıkma hedefini konu alır. 6. Stone Ocean: 2011 yılında, haksız yere hapse atılan Jolyne Cujoh'un babasını kurtarmak ve Dio'nun mirasını sürdüren düşmanlarıyla yüzleşmesini işler. Ayrıca, mangadaki sıradaki hikâye olan Steel Ball Run da gelecekte animeye uyarlanması beklenen bölümler arasındadır.