İskitlerin kökeni hakkında çeşitli teoriler bulunmaktadır: 1. Orta Asya Kökenli: Lomonosov Moskova Devlet Üniversitesi antropologlarının araştırmalarına göre, İskitlerin gen havuzu Orta Asya'ya kadar uzanmaktadır. 2. Hint-Avrupa Dili Konuşanlar: Heredot gibi antik yazarlar, İskitler'in Hint-Avrupa dil ailesine mensup bir halk olduğunu ve kökenlerinin Orta Asya'ya dayandığını belirtmektedir. 3. İran Kökenli: Bazı kaynaklar, İskitler'in İran kökenli olduğunu ve İran dilinin İskit kolunu konuştuğunu öne sürmektedir. Ayrıca, İskitler'in kökenlerinin Türklerin atalarına dayandığına dair varsayımlar da bulunmaktadır.