İnci Taneleri dizisi, çeşitli nedenlerle eleştirilmektedir: Pavyon sahneleri: Ankara Seymenler Kulübü Derneği Başkanı'nın da belirttiği gibi, dizideki pavyon kültürünün Ankara için övünülecek bir konu olmadığı ve ahlaki düşüklük ile kadın sömürüsünün merkezi olduğu görüşleri bulunmaktadır. Senaryo eleştirileri: Bazı izleyiciler, dizinin senaryosunu mantıksız ve dramatik bulmaktadır. Torpil iddiaları: Dizinin Altın Kelebek Ödülleri'nde "En İyi Dizi" seçilmesi, sosyal medyada bazı kullanıcılar tarafından "torpilli" olarak eleştirilmiştir. Kadın cinayetlerinin romantize edilmesi: Dizinin tanıtımında yer alan ifadelerin kadın cinayetlerini romantize ettiği iddiaları da bulunmaktadır.