"ID: Invaded", sanal gerçeklik dünyasında geçen bir dedektiflik hikayesini anlatır. Dizinin konusu, Katillerin bilinçaltlarına girerek onların "id kuyuları" olarak adlandırılan zihinsel düzlemlerine dalan ve bu sayede cinayet vakalarını çözmeye çalışan dedektif Sakaido etrafında döner. Bu dünyada, insanların bilinçaltı düşünceleri nadiren organize olduğu için, her şey parçalanmış veya sembolik bir halde görünür ve bu kuyular sadece kurbanlar veya diğer katiller tarafından erişilebilir.