"Hyouka" animesi, lise hayatına yeni başlayan bir grup öğrencinin başlarından geçen gizemli maceraları anlatıyor. Ana hikaye, Houtarou Oreki'nin ablasının isteği üzerine Klasik Edebiyat Kulübü'ne katılmasıyla başlar. Bu gizemler arasında, okulda çalınan eşyaların bulunması veya bir öğrencinin okuldan atılma nedeni gibi olaylar yer alır. Animede ayrıca, kültür festivalleri ve sakura ağaçları gibi günlük yaşam sahneleri de işlenmiştir.