"Hunter x Hunter: The Last Mission" filmi, Hunter Birliği'nin başkanı Isaac Netero'nun hikayesini anlatıyor. Yıllar önce, Netero, "On" adlı karanlık "gölge"yi kullanmakta ustalaşmış bir Avcı olan Jed'i mühürlemiştir. Filmde, Netero'nun son görevi, Birliği ve dünyayı nefret ve intikam arzusuyla hareket eden bu tehditten korumaktır.