G.I. Joe 2: Misilleme (G.I. Joe 2: Retaliation), G.I. Joe ekibinin, Kobra Komutanı ve Destro'nun bir yeraltı hapishanesine gönderilmesinin ardından, Pakistan liderinin suikaste uğraması sonucu tekrar göreve çağrılmasını anlatıyor. Ekip, ABD başkanının verdiği görevi başarıyla tamamlamasına rağmen, beklenmedik bir saldırıya uğrar ve birçok üyesini kaybeder. Yönetmenliğini Jon M. Chu'nun yaptığı filmin senaryosu Rhett Reese ve Paul Wernick ikilisine aittir.