"Esrarengiz Kasaba Günlükleri", çizgi filmin ana karakteri Dipper'ın ormanda bulduğu 30 yıllık günlüğün hikayesini anlatır. Günlüğün konusu: Dipper, Gizemli Kulübe'nin tabelalarını asarken Esrarengiz Kasaba'daki gariplik ve gizemleri içeren bu günlüğü keşfeder ve kardeşi Mabel ile birlikte kasabadaki çeşitli gizemli olayları ve yaratıkları çözmeye çalışırlar.