Counterpart dizisi, çalıştığı şirkette paralel evrene açılan bir kapı olduğunu keşfeden bir adamın hikayesini konu ediyor. Birleşmiş Milletler'e bağlı Berlin merkezli bir casusluk ajansında çalışan Howard Silk, neredeyse 30 yıldır aynı şirkette çalışmaktadır ve tam olarak ne iş yaptığını bilmemektedir. Counterpart dizisinin anlattığı diğer konular arasında şunlar yer alıyor: iki paralel dünya arasındaki diplomatik ve ticari ilişki; iki dünyada yapılan farklı buluşlar; grip salgını nedeniyle bir tarafın diğerini suçlaması; diğer dünya kökenli bir plan; eğitimli katiller ve onların bu dünyadaki kopyalarını öldürüp yerlerine geçmeleri; iki taraf arasındaki soğuk savaş.