Castle 6. sezon, Richard Castle ve Kate Beckett'in düğün planlarını ve en ilgi çekici davalarını ele alıyor. Sezon boyunca ele alınan bazı davalar ve olaylar: Ölümcül toksin: Castle, bir toksin nedeniyle zehirlenir ve Beckett ona bir günden az ömrü kaldığını bildirir. Beckett'in yeni kariyeri: Beckett, Adalet Bakanlığı'nda yeni bir işe başlar ve bu, onu hayattan çok hoşlanan sevgilisinden uzaklaştırır. Simon Doyle: Bir adam, insanlığı kurtarmak için gelecekten geldiğini iddia eder ve Castle ile Beckett'e profesyonel ve romantik geleceklerini anlatır. Ortaçağ hazinesi: Bir ortaçağ hazinesi, keşişlerin kıskançlığını uyandırır. Üçlü Katil: Korkunç "Üçlü Katil" geri döner. Terk edilmiş bebek: Bir bebek kilisede terk edilir. Kundakçı: Bir kundakçı, Ryan ve Esposito'yu tuzağa düşürür.