"Buddy Complex" animesi, lise öğrencisi Aoba'nın dev bir robot tarafından saldırıya uğraması ve sınıf arkadaşı Hina tarafından kurtarılmasıyla başlar. Aoba, 70 yıl sonra 2088'de uyanır ve Hina'nın kaybolduğunu, sadece tokasının kaldığını görür. Hikaye, Aoba'nın yaptığı seçimler ve Dio'yu nasıl değiştirdiği üzerine kuruludur. Animenin sonunda, olayların nasıl başladığını anladığımız sahnede bir paradoks hissi yaratılır. Konu Özeti: Ana Karakter: Aoba Watase, sıradan bir lise öğrencisidir. Düşman Ülkeler: Free Pact Alliance ve Zogilia Cumhuriyeti savaştadır. Aşk Hikayesi: Hina ve Bizon'un aşkı, Hina'nın zaman döngüsünde sıkışıp kalmasına neden olur. Final: Aoba ve Hina, büyük patlamadan sonra kendi zamanlarına geri döner ve barış sağlanır.