Assassination Classroom animesinin 1. bölümü, Ay'ın %70'ini yok eden ahtapot benzeri sarı bir yaratığın, Kunugigaoka Ortaokulu'ndaki dışlanmış öğrencilerin bulunduğu 3-E sınıfına öğretmen olarak atanmasıyla başlar. Japonya Savunma Bakanlığı’ndan gönderilen ajan Tadaomi Karasuma, öğrencilere önlerindeki eğitim-öğretim yılı boyunca bu gizemli yaratığı öldürmeleri gerektiğini, aksi takdirde 13 Mart’ta Dünya’yı da yok edeceğini açıklar. Normal silah ve kesici aletlerin yaratığa zarar veremeyeceği, suikast girişimleri için özel olarak üretilmiş BB mermileri ve plastik benzeri bıçaklar kullanmaları gerektiği belirtilir. Böylece, her an ölümle yaşam arasındaki ince çizgide ilerleyen 3-E sınıfı için macera dolu bir yılın kapıları aralanır.