"Ang Mutya ng Section E", diğer adıyla "The Jewel of Section E", lisede yeni bir başlangıç yapmaya çalışan Jay-jay'in hikayesini anlatır. Yaramazlar sınıfı olarak bilinen E Bölümü'nün tek kızı olan Jay-jay, kısa sürede erkek sınıf arkadaşlarının şakalarının ve onu kaçırmaya yönelik planlarının hedefi haline gelir. Bu süreçte beklenmedik dostluklar filizlenir ve komik yanlış anlamalar kalp çarpıntısına sebep olan anlara yol açar. Jay-jay, E Bölümü'nün çılgınlığından sağ çıkabilecek mi, yoksa onların kalbini fethetmeyi mi başaracak, dizi boyunca izlenen bir hikayedir.