Anakonda 3: Varoluş, bir milyarderin ölümcül hastalığını iyileştirebilecek bir yılanı yakalama görevini kabul eden kiralık bir paralı askeri konu alır. Film, insanoğlunun bilim ve teknoloji karşısındaki çaresizliğini, maddi gücün her şeyi satın alabileceği yanılsamasını ve doğayla olan savaşı ele alır. Ayrıca, baş karakterin hem hayatta kalma mücadelesi vermesi hem de bir yılan avının peşinde olması, filmi daha karmaşık ve düşündürücü hale getirir.