Ayla filminin çekimleri, 2016 yılında başlayıp 2017 yılında tamamlanmıştır .
Türkiye'deki çekimler, çoğunlukla Mersin'in Tarsus ilçesinde gerçekleştirilmiştir . Tarsus'un tarihi binaları da çekimlerde kullanılmıştır .
Güney Kore'deki çekimler ise Seul'de yapılmıştır . Gazeteci Özge'nin Ayla'ya ulaşmaya çalıştığı sahneler için film ekibi, Seul'de dört gün çekim gerçekleştirmiştir .