Domatesin daha fazla meyve vermesi için çiçeklenme ve meyve bağlama dönemlerinde dengeli NPK gübreleri kullanılabilir. NPK gübreleri, azot, fosfor ve potasyum içerir. Azot (N), vejetatif büyümeyi destekler ancak fazla azot, meyve tutumunu azaltabilir. Fosfor (P), çiçeklenme ve meyve üretimini teşvik eder. Potasyum (K), fotosentezi destekler ve meyvelerin olgunlaşmasına yardımcı olur. Ayrıca, kalsiyum ve magnezyum gibi mikro element eksiklikleri yaprak gübresiyle giderilebilir. Gübreleme programı, domatesin türü, toprak ve çevre koşulları gibi birçok faktöre bağlıdır. En doğru gübreleme programı için bir tarım uzmanına danışılması önerilir.