Ticaret Bakanlığı'nın hiyerarşisi şu şekildedir: Merkez Teşkilatı: Özel Kalem Müdürlüğü, Basın ve Halkla İlişkiler Müşavirliği, Bilgi Teknolojileri Genel Müdürlüğü gibi birimleri içerir. Bakan Yardımcıları: Ticaret Bakanı'na bağlı olarak İç Ticaret Genel Müdürlüğü, İhracat Genel Müdürlüğü, İthalat Genel Müdürlüğü gibi birimleri yönetir. Genel Müdürlükler: Esnaf, Sanatkârlar ve Kooperatifçilik Genel Müdürlüğü, Gümrükler Genel Müdürlüğü, Hukuk Hizmetleri Genel Müdürlüğü gibi birimler. Bölge Müdürlükleri: Batı Akdeniz Güm. ve Dış Tic. Bölge Müd., İstanbul Güm. ve Dış Tic. Bölge Müd. gibi 18 bölge müdürlüğü. Serbest Bölge Müdürlükleri: Doğrudan bakanlığa bağlıdır. Ticaret İl Müdürlükleri: Gümrük ticaret denetmenlerinin görev yaptığı birimler. Bakanlığın teşkilat yapısı, Cumhurbaşkanlığı Kararnamesi ile belirlenir ve bu kararname Resmi Gazete'de yayınlanır.